一、總經理室:

（一）中、長期專案計畫之統籌、規劃、研擬。

（二）年度專案計畫之控管。

（三）研發成果推廣事宜。

二、創新設計部：

（一）創新服務組：產業創新服務之研究、媒合、加值應用、商機促進、推廣，以及相關計畫之規劃、推動及執行。

（二）資通訊應用組：資通訊技術應用於自行車及健康科技相關產業產品之研究、應用與推廣。

三、技術研發部：

（一）產品研發組：自行車與健康科技相關產品之創新設計及關鍵技術之研發與推廣。

（二）智慧製造組：自行車與健康科技相關產業之智慧製造與先進製造技術之研發與推廣。

四、檢測驗證部：

（一）檢測驗證組：自行車與健康科技相關產業之產品標準規範研究、檢測技術建立、工業委託服務等。

（二）檢測技術組：電動輔助自行車與相關產業等產品標準規範研究、檢測技術建立、工業委託服務等。

（三）檢測業務組：檢測業務執行與成果推廣。

五、產業學院：

（一）知識管理組：自行車與健康科技相關產業資訊系統及知識庫之規劃建立與運作，人才培訓課程之規劃與執行。

（二）產業服務組：產業行銷、服務管理及策略研析等各類以產業為主體之專案推動。

六、電動輔助自行車部：核心能力與關鍵技術（控制器、馬達、電池等）之研究、建立與開發，以及相關技術之推廣與服務。

七、健康促進應用部：以健康與保建為導向，整合在地產、學、研之研發能量及健康服務機構，帶動在地產業創新與升級。

八、行政部：

（一）人事：主辦各項人事業務、董監事會議召開，以及員工教育訓練事宜。

（二）總務：中心各項營繕業務之規劃與執行、郵件收發、圖書室管理、財產管理等。

（三）出納：員工薪資、獎金、退休金核計發放；現金、收入以及各項票據之出納處理。

（四）採購：依據中心採購規章辦理採購業務。

九、會計部：概算、預算之籌編、執行與控制；憑證審核與各項帳務處理；決算書之編製與會計師查核相關事項。